Druhý díl mini-dokumentů ukazuje, jak Crystal Dynamics a Flying Wild Hog přetvořili Peru, tedy úplně první level z originálu z roku 1996. Místo oddělených místností je teď celá oblast propojená, takže hráč prochází horskými jeskyněmi až po Vilcabambu jako jedním souvislým místem, ne jednotlivými herními úrovněmi.
Vývojáři popisují kontrast mezi ledovými horami na začátku a tropickou džunglí Ztraceného údolí, kam se hráč postupně dostane. K tomu přibyla historie Inků, příběh Qualopeca a města Vilcabamba i nová hádanka postavená na incké technice uzlového písma khipu. Podle týmu zůstaly ve hře všechny původní secrety z roku 1996, jen jich přibylo mnohem víc, a k tomu i nové možnosti pohybu, třeba klouzání po ledu.